Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HellsQ60848 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HellsQ60848 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HellsQ60848 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HellsQ60848 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HellsQ60848 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HellsQ60848 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HellsQ60848 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HellsQ60848 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HellsQ60848 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HellsQ60848 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HellsQ60848 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HellsQ60848 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HellsQ60848 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HellsQ60848 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HellsQ60848 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HellsQ60848 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HellsQ60848 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HellsQ60848 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HellsQ60848 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HellsQ60848 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HellsQ60848 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HellsQ60848 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HellsQ60848 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HellsQ60848 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HellsQ60848 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms