Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnot7Q60809 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnot7Q60809 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cnot7Q60809 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnot7Q60809 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cnot7Q60809 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms