Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Sik1Q60670 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sik1Q60670 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sik1Q60670 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sik1Q60670 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sik1Q60670 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sik1Q60670 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms