Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A1cfQ5YD48 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A1cfQ5YD48 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A1cfQ5YD48 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
A1cfQ5YD48 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
A1cfQ5YD48 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms