Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Pabpn1lQ5XFR0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pabpn1lQ5XFR0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pabpn1lQ5XFR0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pabpn1lQ5XFR0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms