Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tnfsf15Q5UBV8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnfsf15Q5UBV8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfsf15Q5UBV8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.3 ms