Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpa6Q5U901 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpa6Q5U901 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpa6Q5U901 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpa6Q5U901 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms