Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc5a6Q5U4D8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc5a6Q5U4D8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc5a6Q5U4D8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms