Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Scaf1Q5U4C3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30,02■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Scaf1Q5U4C3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Scaf1Q5U4C3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29,89■■■□□ 2,38
Scaf1Q5U4C3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,89■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
Scaf1Q5U4C3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms