Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc125Q5U465 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc125Q5U465 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc125Q5U465 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc125Q5U465 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc125Q5U465 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms