Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TefmQ5SSK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TefmQ5SSK3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TefmQ5SSK3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms