Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PkdccQ5RJI4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PkdccQ5RJI4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PkdccQ5RJI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PkdccQ5RJI4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PkdccQ5RJI4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms