Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nsrp1Q5NCR9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nsrp1Q5NCR9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nsrp1Q5NCR9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nsrp1Q5NCR9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nsrp1Q5NCR9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nsrp1Q5NCR9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nsrp1Q5NCR9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nsrp1Q5NCR9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nsrp1Q5NCR9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nsrp1Q5NCR9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Nsrp1Q5NCR9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nsrp1Q5NCR9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms