Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim58Q5NCC9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim58Q5NCC9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trim58Q5NCC9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim58Q5NCC9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trim58Q5NCC9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms