Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Trpm3Q5F4S9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trpm3Q5F4S9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trpm3Q5F4S9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Trpm3Q5F4S9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Trpm3Q5F4S9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Trpm3Q5F4S9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms