Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrig2Q52KR2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrig2Q52KR2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrig2Q52KR2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrig2Q52KR2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrig2Q52KR2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrig2Q52KR2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrig2Q52KR2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrig2Q52KR2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lrig2Q52KR2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrig2Q52KR2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig2Q52KR2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig2Q52KR2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrig2Q52KR2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.7 ms