Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA45

Uncharacterized protein C11orf95 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q4VA45 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Q4VA45 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Q4VA45 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Q4VA45 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Q4VA45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Q4VA45 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Q4VA45 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Q4VA45 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Q4VA45 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Q4VA45 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Q4VA45 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Q4VA45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Q4VA45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Q4VA45 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q4VA45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q4VA45 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Q4VA45 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q4VA45 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Q4VA45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Q4VA45 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Q4VA45 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q4VA45 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q4VA45 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q4VA45 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Q4VA45 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q4VA45 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Q4VA45 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Q4VA45 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Q4VA45 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Q4VA45 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4VA45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4VA45 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4VA45 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4VA45 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Q4VA45 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4VA45 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4VA45 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Q4VA45 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4VA45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4VA45 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Q4VA45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Q4VA45 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4VA45 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4VA45 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4VA45 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4VA45 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4VA45 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Q4VA45 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4VA45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4VA45 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4VA45 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Q4VA45 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q4VA45 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q4VA45 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q4VA45 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q4VA45 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q4VA45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Q4VA45 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Q4VA45 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4VA45 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Q4VA45 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4VA45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Q4VA45 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4VA45 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4VA45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4VA45 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Q4VA45 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4VA45 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4VA45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4VA45 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4VA45 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4VA45 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Q4VA45 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4VA45 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Q4VA45 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Q4VA45 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Q4VA45 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Q4VA45 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Q4VA45 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Q4VA45 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Q4VA45 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4VA45 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Q4VA45 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Q4VA45 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q4VA45 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Q4VA45 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Q4VA45 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4VA45 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4VA45 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4VA45 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Q4VA45 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Q4VA45 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q4VA45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q4VA45 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Q4VA45 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4VA45 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4VA45 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4VA45 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4VA45 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Q4VA45 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms