Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Ccdc84Q4VA36 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Ccdc84Q4VA36 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Ccdc84Q4VA36 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Ccdc84Q4VA36 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25,78■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Ccdc84Q4VA36 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,7 ms