Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fam228bQ497Q6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fam228bQ497Q6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fam228bQ497Q6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fam228bQ497Q6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fam228bQ497Q6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms