Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ckap2Q3V1H1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ckap2Q3V1H1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ckap2Q3V1H1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ckap2Q3V1H1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ckap2Q3V1H1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms