Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ttc9Q3V038 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc9Q3V038 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ttc9Q3V038 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ttc9Q3V038 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms