Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrfip1Q3UZ39 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrfip1Q3UZ39 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrfip1Q3UZ39 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrfip1Q3UZ39 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms