Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rnpc3Q3UZ01 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnpc3Q3UZ01 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnpc3Q3UZ01 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rnpc3Q3UZ01 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnpc3Q3UZ01 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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