Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQN2

Fcho2, F-BAR domain only protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho2Q3UQN2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fcho2Q3UQN2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fcho2Q3UQN2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fcho2Q3UQN2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms