Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
D13Ertd608eQ3UPR8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
D13Ertd608eQ3UPR8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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D13Ertd608eQ3UPR8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms