Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep63Q3UPP8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cep63Q3UPP8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cep63Q3UPP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cep63Q3UPP8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173 ms