Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cracr2aQ3UP38 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cracr2aQ3UP38 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cracr2aQ3UP38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cracr2aQ3UP38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms