Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CrxosQ3UL53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CrxosQ3UL53 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CrxosQ3UL53 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CrxosQ3UL53 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms