Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc61Q3UJV1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc61Q3UJV1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc61Q3UJV1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc61Q3UJV1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms