Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LchnQ3UHG7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LchnQ3UHG7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LchnQ3UHG7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LchnQ3UHG7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LchnQ3UHG7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms