Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Arfgef3Q3UGY8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arfgef3Q3UGY8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arfgef3Q3UGY8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef3Q3UGY8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef3Q3UGY8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms