Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Garem1Q3UFT3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Garem1Q3UFT3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Garem1Q3UFT3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Garem1Q3UFT3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms