Protein–RNA interactions for Protein: Q3U962

Col5a2, Collagen alpha-2(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a2Q3U962 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col5a2Q3U962 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col5a2Q3U962 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col5a2Q3U962 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Col5a2Q3U962 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col5a2Q3U962 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col5a2Q3U962 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col5a2Q3U962 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col5a2Q3U962 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Col5a2Q3U962 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col5a2Q3U962 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Col5a2Q3U962 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col5a2Q3U962 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms