Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem35bQ3U0Y2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem35bQ3U0Y2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem35bQ3U0Y2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms