Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Palb2Q3U0P1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Palb2Q3U0P1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Palb2Q3U0P1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Palb2Q3U0P1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms