Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TchpQ3TVW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TchpQ3TVW5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TchpQ3TVW5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TchpQ3TVW5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms