Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc102aQ3TMW1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc102aQ3TMW1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc102aQ3TMW1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms