Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fubp3Q3TIX6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fubp3Q3TIX6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fubp3Q3TIX6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fubp3Q3TIX6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fubp3Q3TIX6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms