Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stt3bQ3TDQ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stt3bQ3TDQ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stt3bQ3TDQ1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stt3bQ3TDQ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stt3bQ3TDQ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.4 ms