Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Jmjd8Q3TA59 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Jmjd8Q3TA59 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Jmjd8Q3TA59 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Jmjd8Q3TA59 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms