Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prr27Q3SYJ2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prr27Q3SYJ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prr27Q3SYJ2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prr27Q3SYJ2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms