Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q3KNL4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q3KNL4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3KNL4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3KNL4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3KNL4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3KNL4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q3KNL4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3KNL4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3KNL4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q3KNL4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3KNL4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3KNL4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3KNL4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3KNL4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3KNL4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3KNL4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3KNL4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q3KNL4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms