Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rtl9Q32KG4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rtl9Q32KG4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rtl9Q32KG4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rtl9Q32KG4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.9 ms