Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Trpm1Q2TV84 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Trpm1Q2TV84 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Trpm1Q2TV84 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Trpm1Q2TV84 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Trpm1Q2TV84 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Trpm1Q2TV84 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms