Protein–RNA interactions for Protein: Q2HXL6

Edem3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edem3Q2HXL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Edem3Q2HXL6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Edem3Q2HXL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Edem3Q2HXL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Edem3Q2HXL6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Edem3Q2HXL6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms