Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpne9Q1RLL3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne9Q1RLL3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne9Q1RLL3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne9Q1RLL3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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