Protein–RNA interactions for Protein: Q1HCM0

Fgfbp3, Fibroblast growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfbp3Q1HCM0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fgfbp3Q1HCM0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fgfbp3Q1HCM0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fgfbp3Q1HCM0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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