Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Myo3bQ1EG27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo3bQ1EG27 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Myo3bQ1EG27 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Myo3bQ1EG27 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Myo3bQ1EG27 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms