Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b1Q148W0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b1Q148W0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atp8b1Q148W0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b1Q148W0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b1Q148W0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b1Q148W0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Atp8b1Q148W0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Atp8b1Q148W0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp8b1Q148W0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp8b1Q148W0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp8b1Q148W0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Atp8b1Q148W0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp8b1Q148W0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp8b1Q148W0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms