Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntnap5cQ0V8T7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cntnap5cQ0V8T7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntnap5cQ0V8T7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms